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R语言:SMOTE - Supersampling Rare Events in R:用R对非平衡数
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-09 热度:85
SMOTE - Supersampling Rare Events in R:用R对稀有事件进行超级采样 在这个例子中将用到以下三个包 {DMwR} - Functions and data for the book “Data Mining with R” and SMOTE algorithm:SMOTE算法 {caret} - modeling wrapper,functions,commands:模型[详细]
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寻找第K大数的方法
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-09 热度:193
寻找一堆数中第K大的数,第一感觉是排序,然后将排序之后的值取第K个。但是实际上,这种方式最少的时间复杂度是O(nlogn)。有更简单的方式可以实现线性的时间复杂度。 算法总是有穷尽的,而思想无穷尽,而实用算法的本质是用空间去换取时间。 这里的方案是:[详细]
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《hadoop进阶》PeopleRank从社交关系中挖掘价值用户
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-07 热度:142
转载请注明出处: 转载自? Thinkgamer的CSDN博客: blog.csdn.net/gamer_gyt 代码下载地址:点击查看 1:PageRank 与 PeopleRank 2:需求分析:挖掘CSDN博客的价值用户 3:算法模型:PeopleRank算法 4:架构设计:从数据准备到PR算法的MR化 5:程序开发:had[详细]
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XTU 1247 Robb#39;s Problem
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-07 热度:50
Robb’s Problem [ Submit Code ] [ Top 20 Runs ] Acceteped : 48 ? Submit : 335 Time Limit : 1000 MS ? Memory Limit : 65536 KB ? Description Robb’s Problem 题目描述 Robb想知道阶乘 n ! 第 m 位数码是什么? 输入 第一行是一个整数 T , ( 1 ≤ T[详细]
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基因数据处理38之dbSnpId到omimId的映射表
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-07 热度:120
1.下载: 首先收到【2】,来源是【2】 【1】中有描述: You can also get those SNPs with an OMIM ID number by downloading from the dbSNP FTP site: the OmimVarLocusIdSNP table contains the information you need for your organisim of interest (hu[详细]
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基因数据处理39之mango安装记录
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-07 热度:116
更多代码请见:https://github.com/xubo245/AdamLearning 1解释 mango安装记录 mango主要是在adam上实现 可视化平台 A scalable genome browser 2.代码: git clone https: //github.com/bigdatagenomics/mango.git cd mangomvn clean package -DskipTests[详细]
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基因数据处理41之mango使用失败
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-07 热度:182
hadoop@Master:~/xubo/tools/adam- 2.10 - 0.19 -git/bin$ mango-submit /xubo/mango/snap/datatest .fa .adam -read_files /xubo/mango/snap/datatest2 .sort .bam .adam -var_files /xubo/mango/snap/datatest2 .flt .vcf .adam -feat_file /xubo/mango/sn[详细]
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51NOD 1116 K进制下的大数(字符串取模 + 枚举)
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-07 热度:165
传送门 1116 K进制下的大数 基准时间限制:1 秒 空间限制:131072 KB 分值: 20 难度:3级算法题 收藏 关注 有一个字符串S,记录了一个大数,但不知这个大数是多少进制的,只知道这个数在K进制下是K - 1的倍数。现在由你来求出这个最小的进制K。 例如:给出的[详细]
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poj3181 Dollar Dayz (DP+大数)
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-07 热度:55
Dollar Dayz Crawling in process... Crawling failed Time Limit: 1000 MS???? Memory Limit: 65536 KB???? 64bit IO Format: %I64d %I64u Submit Status Practice POJ 3181 Appoint description: System Crawler (2016-05-27) Description Farmer John goe[详细]
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基因数据处理40之bedtools的安装和使用
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-07 热度:55
1.下载: git clone https: //github.com/arq5x/bedtools.git 2.编译: make 3.配置: cp * /usr/local /bin/ 4.运行: bam变成bed hadoop @Master :~/xubo/data/snap $ bamToBed -i datatest.sorted.bam datatest.sorted.bed 查看: hadoop @Master :~/xubo[详细]
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基因数据处理42之mango问题_seqdict.avro不存在解决
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-07 热度:118
参考【1】中问题解决 问题分析:这是新版本的问题:adam0.19.1目前在maven中心仓库没有 解决办法: package org.gcdss.test import java.io.File import java.nio.file.Files import org.apache.parquet.hadoop.metadata.CompressionCodecName import org.ap[详细]
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基因数据处理43之mango之503错误
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-07 热度:167
HTTP ERROR : 503 Problem accessing /. Reason : Service Unavailable Powered by Jetty :// 更详细请见: https://github.com/bigdatagenomics/mango/issues/181[详细]
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WindowsXP SP3 AFD.sys 本地拒绝服务漏洞的挖掘过程
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-07 热度:184
标 题: WindowsXP SP3 AFD.sys 本地拒绝服务漏洞的挖掘过程 时 间: 2013-03-17,15:22:33 这是本人第一次做漏洞挖掘,2月的时候开始研究漏洞挖掘技术,2月24号那天在进行Fuzz测试的时候偶然的发现了一个afd.sys未处理的异常,然后就对这个异常如获至宝的分析[详细]
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520我与大数据有个约会——上海大数据创新应用论坛完美落幕
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-07 热度:176
2016年5月20日周五下午,由上海市大数据联盟牵头,慧与(中国)有限公司、联通小沃科技与华院数据共同承办,来自金融服务业、运营商、零售及电商、制造等行业的大数据应用先行者们为各行各业170余位来宾们打开了一扇通向大数据应用落地彼岸的智慧之门。会议由[详细]
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基因数据处理31之avocado运行avocado-cli中的avocado问题3-变异
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-07 热度:72
读入的read为: val fqFile = "hs38DHSE1L100F1.sam" 读取结果: cleanedReads. count : 1 { "readNum" : 0 , "contig" : { "contigName" : "chrUn_KN707963v1_decoy" , "contigLength" : 62955 , "contigMD5" : null , "referenceURL" : null , "assembly"[详细]
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基因数据处理32之Avocado运行记录(人造数据集)
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-07 热度:86
主要是需要数据正确,如果中间缺少记录,avocado一般不会成功 1.代码: Avocado修改: /** * Licensed to Big Data Genomics (BDG) under one * or more contributor license agreements. See the NOTICE file * distributed with this work for additional[详细]
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基因数据处理33之Avocado运行记录(参考基因组)
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-07 热度:176
1.数据下载: avocaodo的test resource中 2.预处理: cat Homo_sapiens_assembly19 .fasta | grep -i -n '' Homo_sapiens_assembly19Head .txt cat Homo_sapiens_assembly19Head .txt cat Homo_sapiens_assembly19 .fasta | head - 34770016 |tail - 787820[详细]
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基因数据处理36之qc-metrics安装
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-07 热度:129
更多代码请见:https://github.com/xubo245/SparkLearning Spark中组件Mllib的学习之基础概念篇 1解释 Read and variant metrics,useable for pipeline quality control purposes qc-metrics主要是用于read和变异的度量,流水线质量控制的目的 2.代码: git[详细]
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基因数据处理34之使用samtools和bcftools进行变异分析
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-07 热度:157
1.指令: (1) samtools mpileup -vf Homo_sapiens_assembly19chr20 .fasta NA12878_snp_A2G_chr20_225058 .sorted .bam NA12878_snp_A2G_chr20_225058 .variants 或者: samtools mpileup -vf Homo_sapiens_assembly19chr20 .fasta NA12878_snp_A2G_chr20_[详细]
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推荐系统技术 --- 文本相似性计算(二)
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-07 热度:96
第一篇地址:推荐系统技术之文本相似性计算(一) 上一篇中我们的小明已经中学毕业了,今天这一篇继续文本相似性的计算。 首先前一篇不能解决的问题是因为我们只是机械的计算了词的向量,并没有任何上下文的关系,所以思想还停留在机器层面,还没有到更高的[详细]
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基因数据处理35之使用samtools和bcftools进行变异分析2--连续处
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-07 热度:155
指令: samtools mpileup -uf Homo_sapiens_assembly19chr20 .fasta NA12878_snp_A2G_chr20_225058_longer .sorted .bam | bcftools call -mv NA12878_snp_A2G_chr20_225058_longer .raw .vcf bcftools filter -s LowQual -e '%QUAL20 || DP100' NA12878_snp[详细]
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nyoj 28 大数阶乘
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-07 热度:103
大数阶乘 时间限制: 3000 ?ms ?|? 内存限制: 65535 ?KB 难度: 3 描述 我们都知道如何计算一个数的阶乘,可是,如果这个数很大呢,我们该如何去计算它并输出它? 输入 输入一个整数m(0m=5000) 输出 输出m的阶乘,并在输出结束之后输入一个换行符 样例输入[详细]
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为了驾驭大数据处理,中外互联网巨头做了同样的选择
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-05 热度:152
数据,数据,我要大数据 在今天这个大数据的时代,数据已经成为了许多企业发展的命脉。 图片转自synergicpartners 有些企业需要数据来形成用户洞察,有的企业需要数据来优化业务流程;甚至对于部分企业来说,数据就是他们最珍贵的资产。 在这个卖煎饼都需要[详细]
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R语言做文本挖掘 Part2分词处理
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-05 热度:73
?? 转载:http://www.voidcn.com/article/p-qkxmglmf-pw.html Part2分词处理 【发现有人转载,决定把格式什么重新整理一遍,有时间做个进阶版文本挖掘,恩!原文地址:CSDN-R语言做文本挖掘 Part2分词处理】 在RStudio中安装完相关软件包之后,才能做相关分[详细]
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数盟说 | 用文本挖掘找出50年以来最流行的音乐
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-05 热度:96
【数盟致力于成为最卓越的数据科学社区,聚焦于大数据、分析挖掘、数据可视化领域,业务范围:线下活动、在线课程、猎头服务、项目对接】 本文为数盟原创译文,转载请注明出处,并务必保留本文底部二维码。 从 1958 年开始每年十二月 Billboard 都会发布一个[详细]